2018年4月，《國家稅務總局關于取消股東出口退(免)稅申報責任的公告》(國家稅務總局公告2018年第16號)明確規定，自2018年5月1日起，“出口企業或其他需要實施免稅、退稅的單位仍將提交現行《增值稅納稅申報表》(16號)
回答很多人的問題，答案要具體到退稅申報系統和稅務機關審核更新后！
為什么同時使用免稅、信貸、退稅做出口退稅的企業(絕大多數是制造企業)每個月都要申報退稅？即使是不退稅的商家，也要“零申報”？我們來看看原政策，明確一下:
1.《國家稅務總局關于發布的公告》(2012年第24號公告)第四條第(一)項明確規定:“企業1月份出口的貨物，應在次月增值稅納稅申報當月內，向主管稅務機關報送增值稅納稅申報、免稅退稅申報和營業稅免稅申報”。也就是說，制造企業的月度出口必須在出口月份結束后的申報月份內申報。
2.《國家稅務總局關于有關困難的公告》(國家稅務總局公告2013年第12號)第二條第(二)項明確規定:“出口企業或其他單位應首先通過稅務公司股東負責機關提供的遠程預申報公共服務進行退(免)稅預申報，待排除分錄正確后，方可進行月度申報。如果稅務機關無法提供遠程預申報公共服務，企業可以到負責的稅務機關進行預申報。
出口企業或其他單位可以對生物醫學票據不均勻的出口貨運勞務按月申報退(免)稅，但應在稅務機關按時通過生物醫學檢查前同時辦理退(免)稅。"
12號公告要求月申報前預申報，避免正確錄入，數據不均勻的業務要求也要做退(免)稅申報。
3.《國家稅務總局關于出口退(免)稅申報變更必要性的公告》(國稅發〔2013〕61號)明確規定:“出口貨運勞務和增值稅零稅率應稅公共服務(以下簡稱出口貨運勞務公司取消股東責任和公共服務)，在每月申報出口退(免)稅前，應當根據當前申報的必要性向主管稅務機關進行預申報。主管稅務機關確認申報單的明細與生物醫藥等同一個管理機構的明細無誤后，才能提供明確定義的申報退(免)稅單的電子統計、信息和月申報，并按月向主管稅務機關申報。”
自2014年1月1日起，只允許辦理退(免)稅申報，因為出口業務需要文件資料齊全。如果某個月末沒有退稅申報業務，會出現空塊。由于生產企業退稅需要核對增值稅申報的統計數據，如果增值稅的統計數據在某些月末沒有上報給審核系統，在收到審核后的月末退稅時會造成增值稅不符，給退稅審核帶來困難。因此，從2014年1月1日開始，要求對那些沒有退(免)稅的月份進行“零申報”，即只在退稅申報系統中填寫1月份增值稅申報匯總表(增值稅統計數據)，生成匯總表上報稅務局。這就是制造企業“零申報”的由來。
16改革要求制造企業仍需提交增值稅納稅申報表，稅務機關仍要求制造企業互免退稅申報。對于增值稅數據，系統可以動態獲取和收集系統的增值稅納稅申報表數據。
理論上，在審核更新后，生產企業仍然需要將增值稅統計數據傳輸到審核系統數據，但稅務機關需要從征管系統動態獲取企業申報的增值稅統計數據。那么，當月末沒有退稅申報時，就不需要通過“零申報”來補充增值稅統計了。
那么，取消提交增值稅納稅申報表和“零申報”后，制造企業應如何申報退(免)稅？
1.雖然改革取消了預申報，同時國家稅務總局2013年第61號公告明確規定“文件齊全、數據齊全”后才允許取消月度申報，但仍需以完整的文件和數據申報退稅和出口業務。(國家稅務總局公告2018年第16號第二條:負責稅務機關確認申報單明細無誤，同管理機構生物醫藥。理論上，如果在某個月末沒有數據完整的出口業務，制造企業仍然做“零申報”，只需要在月底數據采集時做退(免)稅申報，和外貿企業的操作一樣。
2.生產企業在申報出口業務退(免)稅數據齊全的情況下，仍需錄入增值稅納稅申報表，但在衛生公司注銷股東承擔納稅申報表責任的情況下，增加了“退稅統計計算”程序，即只能錄入增值稅納稅申報表、不可抵扣累計、寒假留成三項出口營業額累計統計數據。為什么要輸入三個統計？是為了彌補當前退稅匯總表中這些項目因月末未申報退稅而造成的統計數據的不足。如圖: