關于辦理股權變更的疑難問題，首先，法人需要提交并簽署《公司變更登記申請表》，其中應注明指定選擇或共同交付給中介的辦理事項、權限和授權期限，有助于辦理股權變更的事項和程序。
1.公司變更登記通知
2.公司章程議案(全體大股東簽字蓋章)
3.股東大會決議(由全體大股東簽字蓋章)
4.公司執照原件(原件)公司注銷債務
5.各大股東身份證復印件(核對原件)
6.股權轉讓協議原件(注明股權轉讓給誰，股權、債權、債務全部轉讓，轉讓方和受讓方簽字)
1.收到公司變更登記通知
2.變更營業執照(填寫公司變更欄，加蓋公章，領取公司章程議案、股東會決議、股權轉讓協議、公司營業執照的正本和副本)
3.變更機構政府組織機構代碼證(填寫中小企業代碼證變更欄，加蓋上市公司債務注銷章，領取公司變更申請表、營業執照存檔復印件、機構身份證復印件、代碼證原件到質量技術監督局)
4.變更財務發行(將財務變更通知帶到稅務)
5.變更金融機構數據(基本上金融機構變更通知由開戶銀行辦理)
由于股權變更涉及中小企業的外部變更，必須經過立法批準才能進行允許的操作，以達到股權變更的目的。反之，未經立法認可的股權變更是無效的，此時就會發生股權糾紛。為了避免這種情況，中小企業在進行股權變更時必須遵循這些程序。