1、在發明專利申請的流程上；
眾所周知，和其余兩項專利比起來，發明專利申請的流程中，除了申請、初審以及公布、授權下發證書外，還多了其余兩項實質審查與公告階段。其中的實質審查，就是整個發明專利中最大的一個難點。發明人在這之前，無論是做好檢索工作，還是想盡辦法完善自己發明的缺陷和存在的問題，避開與他人發明的技術相同和一致等，最終的目的，都是希望能通過這個實質審查的過程。推薦閱讀：《專利申請的實質審查內容》
2、發明專利申請所需資料的準備上；
除了實質審查很難通過外，在申請之前，發明人需要準備的資料，也是一個難題。例如，常規的發明專利申請，絕對不能缺少了專利內容說明書、權利要求書、以及附圖等這三樣東西。其中無論是哪一樣，在申請中都十分重要，特別是專利說明書，需要發明人具有較好的文字功底，能將自己的發明清晰明確的列出步驟，表達撰述出來，即要能讓審查員理解到，同時還要具備可操作性和實施性、專業性。結合相應的發明構造和附圖，連同專利申請書，一同提交至國家專利局在的地方。