營業稅和增值稅皆是流轉稅，是互斥的，也即一筆收入（或者一筆收入其中的一部分）要么交增值稅，要么交營業稅，不會同時交。但是，也不是可選擇的，而是由業務性質決定的。兩者的具體不同表現如下
1、征稅范圍不同：
增值稅是對其銷售貨物或提供加工、修理修配勞務及進口貨物的單位和個人就其實現的增值額征收的一個稅種.其征收范圍包括銷售貨物、提供加工以及修理修配服務、進口貨物；
營業稅是對在中國境內提供應稅勞務的、轉讓無形資產或銷售不動產的單位和個人，就其所取得的營業額征收的一種稅.在中國境內提供的應稅勞務、轉讓無形資產或銷售不動產，具體包括：交通運輸、建筑安裝、金融保險、郵電通信、文化體育、娛樂、服務業等提供的勞務，及轉讓無形資產和銷售不動產等都是營業稅的范圍；
2、征收的稅務局不同：前者是在國稅征收，后者是在地稅征收；
3、稅率(征收率）不同：
增值稅：按財務核算是否健全及銷售額是否達到標準，分小規模納稅人和一般納稅人，前者征收率為3%，后者稅率為：17%、13%、0（按銷售的貨物不同，稅率不同）；
營業稅稅率：按不同的行業規定不同的稅率，3%-20%不等；
4、增值稅是價外稅，稅金在價外；
營業稅是價內稅，根據發票上的金額以及稅率計算繳納。