最高人民法院于2011年1月27日發布的《最高人民法院關于適用〈中華人民共和國公司法〉若干問題的規定(三)》, 對于有限責任公司，股權代持協議沒有合同法52條規定的情形，其應是有效的，但不能對抗善意第三人。如果名義持股人將名下股權轉讓、質押給善意第三人，其應是有效的，即實際持股人可以因利益受損向名義持股人追償，但無權申請法院判定轉讓和質押行為無效。因此，雖然股份代持協議有效，對于實際出資人與名義出資人來說，仍存在風險。那么存在什么風險呢?
股權代持又稱委托持股、隱名投資或假名出資，是指實際出資人與他人約定，以該他人名義代實際出資人履行股東權利義務的一種股權或股份處置方式。產生代持股份的原因一般有以下幾種：某些實際出資人基于某種考慮不愿意顯示于公司股東名冊或登記機關的備案文件之中;為了規避公司法對公司股東人數的限制;為了規避經營中的關聯交易;為了規避國家法律對某些行業持股上限的限制;為了規避公司對股東身份的特別要求。
一、實際出資人面臨的風險如下：
(1)股份代持協議因違反合同法第52條規定而無效，實際出資人將無法依據該協議向名義股東主張權利。
(2)股東身份不被認可。如果得不到公司半數以上股東認可，實際出資人可能面臨無法轉正的尷尬局面。
(3)名義股東惡意損害實際股東的利益。名義股東可能擅自進轉讓股份、質押股份的行為，股份代持協議實際出資人都很難控制。這是實際出資人所面臨的各項風險中最為嚴重的一種風險。另外，名義股東可能會在股利取得、股份表決權的行使、資產分配等方面背離實際出資人的本意或實施損害實際出資人的行為。
(4)由于名義股東自身原因導致訴訟而被法院凍結保全或者執行名下的代持股權。名義股東如果拖欠債務，其所代持的實際出資人的股權可能會被查封或拍賣。
(5)名義股東去世或者喪失民事行為能力，其所代持的股權的處置將成為一項難題。
(6)其他可能出現的風險。
二、名義股東可能面臨的風險：
(1)如果股份代持協議無效，并且名義股東不愿成為該公司的實際股東并且也沒有出資能力的時候，對于名義股東也是一件非常麻煩的事情。
(2)實際出資人出資不到位，可能會被公司債權人或其他股東追索。這里的出資不到位可能有幾種情況，一種是實際出資人違背約定不愿繼續出資，一種是實際出資人發生客觀變化而喪失繼續出資的能力。
(3)如果雙方約定由實際出資人實際參與公司管理，那么，如果其行為違反公司法規定而被公司或其他股東或債權人主張權利，那么，名義股東很可能被牽涉其中。
(4)如果名義股東因為其股東身份而出任公司負責人的職務，則面臨更多的風險，包括刑事風險